檢察官指控王書君一直是中共政府代理人，至少從2015年起在中共國安部的指導下祕密行動，利用他在紀念基金會和紐約市華人社區中的地位，搜集旅美中國異見人士的信息，並傳遞給兩名青島國安和兩名廣東國安人員。根據起訴書，王書君向國安部報告後，至少有一名香港民主活動人士和持不同政見者被中共國安逮捕。

王書君一直堅稱自己是無辜的。他在2021年4月18日的一份手寫的中文宣誓書中指出，他的父親曾是美國海軍陸戰隊的翻譯，自己則是海戰史專家，並在1994年訪問哥倫比亞大學東亞所。他強調自己親自參與組織了大紐約地區30多場反對中共專制和六四大屠殺的集會活動，但卻遭到「中共線人的誣告」，「企圖打擊摧毀海外反對中共獨裁專制的民主運動」。

昨天（6月26日），王書君身穿黑西裝出庭。法官對王書君的律師董克文（Kevin Tung）提出的13項限制動議做了裁決，允許或拒絕某些特定證據作為呈堂證據，例如批准胡平作為王書君的事實證人（Fact Witness），還有一位沈姓證人作為辯方的專家證人。最終預審會議定於7月17日下午4點舉行